Proteoglykaner består av
proteiner till vilka flera
kolhydrater har kopplats. Så mycket som 85-95 % av vikten består av kolhydrater, är halten mindre än så kallas de istället
glykoproteiner. Proteoglykaner är proteiner som är substituerade med en speciell sorts
polysackarider som kallas GAG's,
glykosaminoglykaner. Dessa glykaner är uppbyggda av en repeterande
disackarid som innehåller en
hexosamin (
glukos- eller galaktosamin)och ett annat
socker, vanligtvis en
hexuronsyra (
glukuron- eller iduronsyra) men ibland en
hexos (
galaktos). Dessa socker är vidare, i varierande grad, substituerade med
acetyl (på hexosaminerna) eller sulfat (på alla socker). De vanligaste varianterna av glykosaminoglykaner är heparansulfat, chondroitinsulfat, dermatansulfat, keratansulfat och
heparin. GAG's har negativt laddade grupper. Det finns alltid negativa karboxylgrupper och ibland också negativt laddade sulfatgrupper.