Podjednotka je v
biochemii termín pro urcitou molekulu proteinu, která se spolu s jinými proteiny podílí na stavbe bílkovinného komplexu, též oznacovaného jako
oligomerní ci dokonce multimerní (složený ješte z více podjednotek) protein. Jedná se o bežný jev, mezi oligomerní proteinové komplexy, tzn. molekuly složené z více podjednotek, patrí napr.
hemoglobin,
DNA polymerázy,
nukleozomy; mezi multimerní patrí napríklad
iontové kanály,
mikrotubuly ci další složky
cytoskeletonu. Proteinový komplex ze dvou podjednotek se bežne oznacuje jako
dimer.