Mykotoksin er et giftstof, som produceres af forskellige svampearter, hvis toksiditet varierer kraftigt. Hos gærsvampen drejer det sig om
ethanol (
alkohol), men blandt de mere frygtede mykotoksiner kan nævnes
aflatoksin, som produceres af svampen
Aspergillus flavus, og som bl.a forefindes i
nødder og
korn. Indenfor medicin har nogle mykotoksiner vist sig nyttige. F.eks er penicillin et mykotoksin, og det samme gælder for Cyclosporin, som er et præparat, der virker svækkende på
immunsystemet, og derfor er nyttigt ved organ-transplantation. Desuden er visse mykotoksiners psykedeliske effekt velkendt.