Arkæerne (
latin Archaea, fra
græsk αρχαία, "de gamle") er et af de tre
domæner af levende organismer sammen med
bakterier og
eukaryoter. Arkæer og bakterier kaldes samlet for
prokaryoter (fra latin
før kerne). Arkæernes separate
identitet blev opdaget i
1970'erne af Dr. Carl Woese fra University of Illinois ved hjælp af
genetisk sammenligning. Oprindeligt blev arkæerne benævnt arkebakterier, mens de andre prokaryote blev benævnt eubacteria (
ægte bakterier). Der er dog en stigende tendens til at indskrænke termen bakterie til eubacteria. Arkæerne kan behandles som et enkelt rige eller et domæne.
