Als
Zellkompartimente werden in der
Biologie verschiedenartige Räume innerhalb einer
Zelle bezeichnet. Im Gegensatz zu dem Begriff ‚
Organell‘, der sich immer auf ein einzelnes Objekt bezieht (etwa
ein Mitochondrium), wird der Begriff
Kompartiment für die Summe aller gleichartigen zellulären Räume verwendet. Eine Zelle kann demnach viele Mitochondrien haben, aber nur ein mitochondriales Kompartiment. Auch das
Cytoplasma ist ein Kompartiment, aber kein Organell. Weitere Kompartimente der
Eukaryoten werden von den Komponenten des
Endomembransystems, dem
Zellkern und bei Pflanzen von
Plastiden und der
Vakuole gebildet.