総合研究大学院大学は、日本初の博士課程のみの国立大学院大学である。大学卒業者、あるいは大学院修士課程（博士前期課程）修了者を対象とする。前者は5年一貫制博士課程に入学し、後者は5年一貫制博士課程の三年次に編入する（文化科学研究科については、博士後期課程のみを設置している）。6研究科で構成され、各研究科はさらに幾つかの専攻に分かれている。各専攻における研究指導は、基盤機関（大学本部（葉山キャンパス:1995年までは東京工業大学長津田キャンパス）、4つの大学共同利用機関法人に属する16の研究所）、独立行政法人メディア教育開発センター、及び国立研究開発法人宇宙航空研究開発機構宇宙科学研究所）で行われる。

総合研究大学院大学は、日本初の博士課程のみの国立大学院大学である。大学卒業者、あるいは大学院修士課程（博士前期課程）修了者を対象とする。前者は5年一貫制博士課程に入学し、後者は5年一貫制博士課程の三年次に編入する（文化科学研究科については、博士後期課程のみを設置している）。6研究科で構成され、各研究科はさらに幾つかの専攻に分かれている。各専攻における研究指導は、基盤機関（大学本部（葉山キャンパス:1995年までは東京工業大学長津田キャンパス）、4つの大学共同利用機関法人に属する16の研究所）、独立行政法人メディア教育開発センター、及び国立研究開発法人宇宙航空研究開発機構宇宙科学研究所）で行われる。