该群岛最早由瓦斯科·达·伽马发现，18世纪初作为毛里求斯的一部分被法国占领。1814年，根据维也纳和约，法国将该群岛割让给英国，作为塞舌尔的一部分。1903年8月31日，英国将其从塞舌尔划出，重归毛里求斯管理。毛里求斯独立后，英国成立了英属印度洋领地来管理该群岛，但毛里求斯未放弃对其的领土要求。1967年，英国同美国签订条约，在迪戈加西亚岛上修建了空军和海军基地。在两次海湾战争和阿富汗战争期间，迪戈加西亚岛基地均发挥了极其重要的作用。

为修建军事基地，英国将岛民强行迁离，这引起了岛民的不断抗议，2000年，英国高等法院裁决政府的这一行径违法，允许岛民自由返回除迪戈加西亚岛之外的其他诸岛（美国以军事防卫需要为名，禁止平民踏足迪戈加西亚岛）。由于英美两国之间的条约将于2016年到期，该群岛的政治地位仍不明朗。毛里求斯已向联合国人权委员会提出要求，希望在条约过期后取得该岛的主权。

该群岛最早由瓦斯科·达·伽马发现，18世纪初作为毛里求斯的一部分被法国占领。1814年，根据维也纳和约，法国将该群岛割让给英国，作为塞舌尔的一部分。1903年8月31日，英国将其从塞舌尔划出，重归毛里求斯管理。毛里求斯独立后，英国成立了英属印度洋领地来管理该群岛，但毛里求斯未放弃对其的领土要求。1967年，英国同美国签订条约，在迪戈加西亚岛上修建了空军和海军基地。在两次海湾战争和阿富汗战争期间，迪戈加西亚岛基地均发挥了极其重要的作用。

为修建军事基地，英国将岛民强行迁离，这引起了岛民的不断抗议，2000年，英国高等法院裁决政府的这一行径违法，允许岛民自由返回除迪戈加西亚岛之外的其他诸岛（美国以军事防卫需要为名，禁止平民踏足迪戈加西亚岛）。由于英美两国之间的条约将于2016年到期，该群岛的政治地位仍不明朗。毛里求斯已向联合国人权委员会提出要求，希望在条约过期后取得该岛的主权。