Из-за наличия оксигеназной активности у фермента
Rubisco, катализирующего присоединение CO
2 к рибулёзо-1,5-бифосфату на начальной стадиии
цикла Кальвина, вместо ассимиляции углекислоты под воздействием того же фермента возможно окисление рибулёзофосфата с распадом его на 3-фосфоглицериновую кислоту, которая может поступить в цикл, и на фосфат гликолевой кислоты. Он дефосфорилируется и гликолевая кислота транспортируется в
пероксисомы, где окисляется до глиоксилевой кислоты и аминируется с получением
глицина. В митохондриях из двух молекул глицина образуется
серин и углекислый газ. Серин может использоваться для синтеза
белка, либо превращается в 3-фосфоглицериновую кислоту и возвращается в цикл Кальвина.