העלילה העיקרית לכל התקופות בסדרות גנדאם השונות עוסקת במלחמה עקובה מדם שפורצת בין מושבות חלל בתוך גבולות מערכת השמש לכדור הארץ, כאשר במרכז הניצים ניצבות מספר דמויות מפתח משני המחנות. עיקר הנושאים שהוצגו בסדרות כללו פוליטיקה, פילוסופיה, אידאליזם ופציפיזם.